III МКФ «Евразия» прошел в Алматы в 2006 году. В этот год фестиваль получил аккредитацию Международной федерации ассоциаций продюсеров (FIAPF). В это же время наряду с основным конкурсом кинофестиваль начал проводить центрально-азиатский конкурс, жюри которого возглавил туркменский режиссер Ходжакули Нарлиев.
Были проведены ретроспективы фильмов Фолькера Шлендорфа (Германия) и знаменитой иранской семьи Махмальбаф: Мохсена, Самиры, Ханы и Марзии Мешкини. В честь 90-летия со дня рождения мэтра казахского кино Абдуллы Карсакбаева также прошла ретроспектива его фильмов.
Победители основного (международного) конкурса:
Гран-при за лучший фильм – «Эдем» (Германия – Швейцария), реж. Майкл Хофман.
Приз за лучшую режиссерскую работу – Жан Юан («Маленькие красные цветы», Китай).
Специальный приз жюри – «Кек» (Казахстан), реж. Дамир Манабай.
Приз за лучшую женскую роль – Ладан Мо («Прощай жизнь», Иран).
Приз за лучшую мужскую роль – Масато Ибу («Раскачивание», Япония).
Победители центрально-азиатского конкурса:
Гран-при за лучший фильм – «Записки путевого обходчика» (Казахстан), реж. Жанабек Жетыруов.
Приз за лучшую режиссерскую работу – Камара Камалова («Дорога под небесами», Узбекистан).
Приз за лучшую женскую роль – Фатима Гулямова («Овора», Таджикистан).
Приз за лучшую мужскую роль – Тулеген Куанышев («Степной экспресс», Казахстан).